布鲁斯·班纳是伯克利实验室的年轻科学家,一次伽马射线实验发生事故,沉睡在他体内的绿巨人由此苏醒。绿巨人并非普通怪物,而是基因实验与辐射共同催生的存在。布鲁斯与贝蒂·罗斯相爱,却遭到贝蒂父亲罗斯将军的敌视。军方开始追捕绿巨人,布鲁斯的人生从此改变。
事故后,布鲁斯在愤怒中化身绿巨人,拥有摧毁钢铁与墙壁的力量。绿巨人的出现引发恐慌,也让布鲁斯失去正常生活。他不断逃亡,试图弄清绿巨人为何选中自己。记忆深处,父亲大卫·班纳的疯狂实验若隐若现。绿巨人的基因秘密,正藏在布鲁斯的童年创伤里。
布鲁斯逃到旧金山,终于见到贝蒂,也找到父亲大卫。大卫揭示真相:他早年用自身做实验,把变异基因传给儿子。绿巨人不是外来灾祸,而是班纳家族执念的延续。大卫还想复制绿巨人的力量,开始吸收电力与金属,逐渐变成可怕的吸收人。
罗斯将军率领军队围捕绿巨人,贝蒂夹在父亲与爱人之间。绿巨人与军方的冲突不断升级。布鲁斯努力控制愤怒,可绿巨人的本能一次次冲破束缚。他既要躲避炮弹,也要保护贝蒂。绿巨人的每一步都带来破坏,也带来更深的孤独。
高潮中,大卫吸收过多能量,身体失控。绿巨人迎战吸收人,在沙漠与基地之间展开决战。军队的伽马炸弹没能杀死绿巨人,反而让战斗更加危险。最终,大卫被能量反噬,绿巨人也在痛苦中怒吼。布鲁斯明白,绿巨人无法被彻底消灭,只能学会与之共存。
结尾,布鲁斯隐居南美丛林,绿巨人的吼声在雨林深处回荡。贝蒂目送他离开,明白爱不能消除绿巨人的诅咒。绿巨人电影电影版剧情解说以悲剧收束:布鲁斯拥有毁灭力量,也背负孤独宿命。绿巨人是愤怒的化身,也是人性的伤口。绿巨人仍在等待和平,等待一个能接纳自己的世界。